中心创建于2013年，核心使命是：以基因组工程、工具酶开发、微流控器件、大数据技术等为主要方法学支撑，围绕工业微藻细胞工厂构建、微生物组快检及机制等研究体系的关键瓶颈问题，开发单细胞分析、分选、测序与培养技术，研制与产业化单细胞分析仪器系列，从国产装备的角度支撑单细胞大数据网络和微生物组天网等原创大数据系统，服务于工业生物技术、大健康、海洋资源挖掘、环境保护与修复、生物安全等应用领域。

经过多年的沉淀与积累，中心多项自主研发项目已进入产业化阶段，包括：

（一）单细胞分析仪器系列

包括服务“临床药敏快检”的CAST-R™（临床单细胞拉曼药敏快检仪），满足自动化需求的FlowRACS^®（高通量流式拉曼分选仪），构建细胞表型组与基因组关联的RACS-Seq^®（单细胞拉曼分选-测序耦合系统），便携式EasySort^®（单细胞微液滴分选系统）等。

（二）单细胞分析试剂盒与耗材系列

推出了支撑细菌、古菌、真菌、微藻、植物、动物、人体等单细胞分析的试剂盒与耗材，覆盖了包括单细胞分析样品采集、样品预处理、拉曼成像、拉曼分选、单细胞测序文库、单细胞培养等环节的完整实验与数据分析流程。

（三）软件、数据库与搜索引擎

包括RamLIS拉曼控制软件、RamEX拉曼分析软件、RamDB光谱数据库、微生物组搜索引擎（MSE；http://mse.ac.cn）。