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开发服务于单细胞表型筛选的液滴打印平台

作者:葛安乐   时间:2024-01-22   点击数:

随着基因组合成与编辑技术的迅猛发展,基于液滴的单细胞表型筛选的意义显得尤为重要。然而,如何精准、高通量地将目标单液滴分配到特定的宏观介质中,进而完成下游多组学分析,仍然是一个技术挑战。近日,青岛能源所单细胞中心开发了一种基于液滴打印的平台,以“单孔单液滴”方式将含有单克隆的液滴打印至培养皿或96孔板中,从而服务规模化、低成本、全自动的单细胞表型获取和筛查。上述工作近日发表于化学传感领域权威期刊《传感器和执行器B:化学》(Sensors and Actuators B: Chemical)杂志。

服务于单细胞表型筛选的液滴打印平台(图/刘阳)

传统筛选方法,如琼脂平板和微孔板筛选,是目前应用最广泛的两种筛选策略。琼脂平板法操作简单,但难以准确定量,主要用于菌株的初筛。微孔板筛选能精准定量,便于评价突变体的性能,但通量较低。

基于液滴微流控的工具有望满足超高通量筛选的需求,但目前大多数的分选策略只能将表型一致的液滴富集到一个通道中,难以将每个“目标液滴”高精度、高通量、自动化地分离到宏观介质(如培养皿、96孔板)的特定空间位置,以开展下游单细胞培养、测序等实验。

针对上述问题,单细胞中心葛安乐助理研究员和刁志钿博士(在读)等人带领的研究小组基于电流体动力学打印技术,开发了一种基于液滴打印的芯片化平台,以“单孔单液滴”方式将含有单克隆的液滴打印到指定的位置。该平台包括四个主要模块:泵驱动微流控芯片模块、光学自动信号识别模块、高压控制模块和自动化的移动平台模块。芯片中预埋的光纤可引入红光LED,当分选后的目标液滴流过检测窗口时,光纤连接的二级管可识别并产生相应信号,进而利用电流动力学原理将液滴打印到特定区域。

这一芯片平台具有以下特色:首先,不仅能实现在线生成液滴并打印,且可对孵育或分选后液滴进行按需精确打印,打通了“目标液滴群”到“单个目标液滴”的高效渠道,服务下游单细胞层面表型研究。其次,增加了基于光纤传输的光学检测模块,不仅提高液滴打印的准确率,且规避了复杂光路系统;这一简洁而集成化的系统可兼容更多的下游实验场景,如质谱检测、培养皿、96孔板等。

下一步,研究人员将基于前期开发的FlowRACS和RACS-Seq/Culture等单细胞拉曼分选仪器系列,耦合上述高精度按需单液滴打印模块,针对微生物组、大规模突变体文库等复杂生命系统,实现全流程高精度、高通量、自动化的功能单细胞识别、分离、培养和导出,服务于生物资源、合成生物技术、精准医学、深海/深地/深空探索、生物安全等产业。

该工作由单细胞中心马波研究员和徐健研究员主持,得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金委、山东省自然科学基金委、山东能源研究院基金以及国家合成生物学技术创新中心基金的支持。

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.snb.2024.135334

Anle Ge#, Zhidian Diao#, Yuandong Li, Chaojie Cui, Xixian Wang, Yang Liu, Jian Xu*, Bo Ma*. An integrated microfluidic platform for on-demand single droplet dispenser with high accuracy by electrohydrodynamic (EHD) printing technique. Sensors and Actuators B: Chemical, 2024, 405:135334.

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