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单细胞中心承担的中科院STS计划区域重点项目“临床单细胞耐药快检STS网络”项目顺利通过结题验收

作者:崔晓辉   时间:2022-06-10   点击数:

6月9日,青岛能源所单细胞中心承担的中科院STS区域重点项目“临床单细胞耐药快检STS网络”在南方医科大学珠江医院举行结题验收评审及现场测试评估。 会议由中国科学院广州分院与项目承担单位青岛能源所共同组织,中国科学院广州分院科技合作处副处长吴乐主持会议。验收专家组由来自南方医科大学珠江医院、广东省人民医院、广州市第一人民医院、华南农业大学、广东省微生物研究所和中科院广州地球化学研究所的六位技术与财务专家组成。 吴乐首先对出席会议的领导和专家表示欢迎和衷心感谢,随后他宣读了验收专家名单并介绍了项目结题验收的评审要求。项目验收环节,专家组认真听取了项目负责人徐健研究员对项目执行情况、项目代表成果及水平、队伍建设和人才培养、院地合作和科技服务情况等方面的汇报。进而,在珠江医院检验学部,对临床单细胞拉曼药敏快检仪CAST-R仪器系统及其病原快检流程进行了现场测试。专家组充分肯定了项目组在抗感染用药医疗器械的自主创新和应用推广方面做出的贡献,认为该项目完成了立项要求的各项技术任务指标以及应用示范服务目标,经费支出合理,项目管理规范,一致同意该项目通过结题验收。

 

(图/王静)

抗生素滥用与误用造成了耐药性广泛传播,作为遏制耐药性传播与精准用药的前提与关键,临床药敏/耐药快检技术长期没有突破。目前常规方法均无法摆脱细菌培养与纯化过程,通常耗时长达2~3天,对于尚难培养或生长缓慢的病菌更是无能为力。同时,耐药传播的精准防控要求单细胞水平的病原“表型-基因型”追踪,而现有手段却通常只能精确到“细胞群体”水平。 针对这些瓶颈问题,单细胞中心前期发明了重水饲喂单细胞拉曼药敏快检技术,提出了基于代谢抑制的最小药物浓度(MIC-MA)这一全新的药敏性测量参数,并研制成功国内外首台临床单细胞拉曼药敏快检仪CAST-R。进而,通过开发RAGE-Seq等一系列原创的拉曼激活单细胞分选技术,实现了在单个细菌细胞的精度测量其代谢表型组(拉曼光谱)和基因组(或转录组)。“临床单细胞耐药快检STS网络”项目的核心目标是,在CAST-R工程化样机的基础上,通过与临床机构的密切合作,完成CAST-R的临床应用开发和示范。

 

(图/王静)

经过两年的项目实施,该项目完成了对CAST-R的自动化升级改造,新版仪器产品具备基于单细胞代谢抑制评价药敏性、高准确度和可靠性、广谱适用性、定量揭示耐药性的异质性、高通量和自动化等优点;同时开发了仪器配套的单细胞全基因组扩增试剂盒产品,以及单细胞全基因组数据耐药机制分析、病原菌鉴定等软件系统。 同时,该项目建立了“微生物药敏单细胞技术临床示范网络”(SinCheckNet)。项目组在6家重点单位(广州南方医科大学珠江医院、北京协和医院、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所、青岛市市立医院、浙大附属邵逸夫医院、香港大学),针对尿道感染、血液感染、胃部感染、口腔根管感染等临床诊疗场景,以及耐药基因功能机制、持留菌形成机理等基础研究场景,开展了较为全面、系统性的CAST-R应用开发与临床验证工作,发表了一系列论文。同时,利用CAST-R仪器的特色性能,与中国疾病预防控制中心传染病预防控制所合作,项目组示范了直接从胃粘膜等临床样品出发的病原单细胞“耐药表型-基因组”追踪技术,服务于单细胞精度的病原体溯源和耐药传播机制研究。 下一步,单细胞中心将与青岛星赛生物科技有限公司携手,不断完善CAST-R的各项技术指标,加速CAST-R产品的更新迭代,并持续拓展更多临床应用场景,以推动临床病原药敏表型和基因型检测从目前“细胞群体”精度向“细胞个体”精度的范式转变,最终实现“立等可得”的临床抗生素精准用药。

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